我想尝试如何从R markdown文件，但从作为Cron作业运行的bash脚本呈现HTML。 我不知道为什么一切工作正常，除了作为克伦工作。 我做的事：
我的脚本是Rstudio的演示脚本
--- title: "test" author: "sms" date: "24 maja 2015" output: html_document --- This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>. When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this: ```{r} summary(cars) ``` etc. 这个脚本在Rstudio中没有任何问题。
接下来我尝试从terminal运行一个Rmd脚本：
Rscript -e "require( 'rmarkdown' ); render('/home/sms/Dokumenty/R/test.Rmd', 'html_document')"
没有任何问题。 有用。
所以我创build了bash脚本
#!/bin/bash
（'/ home / sms / Dokumenty / R / test.Rmd'，'html_document'）“
并更改了chmod 755 test.sh
也像一个魅力。
但是，当把Cron文件（pipe理员和用户）：
28 18 * * * sh /home/sms/Dokumenty/R/test.sh
它不起作用
任何想法我做错了什么？
我有同样的问题。 这个问题是因为我以root身份运行Rscript，但是Rscript应该以当前用户的身份运行。 为了解决这个问题，我编辑了用户souza“sudo crontab -u souza -e”的crontab，并且Rscript作为souza而不是root来运行。 现在它正在工作
简化，简化，简化。
首先，我将它作为一个RScript，也许称为renderTest.R
#!/usr/bin/Rscript library(rmarkdown) setwd("/home/sms/Dokuments/R") render("test.Rmd") # I usually use default arguments
其次，使脚本可执行（ chmod 0755 renderTest.R ）。
三，测试脚本。 如果你可以像你一样运行它，那么你也应该运行一个cron作业。
第四，添加cronjob运行，因为你有相同的权利。
编辑我只是修复了我从你抄来的错字： Documents/ not Documenty/ 。
我有同样的问题。
但是，如果你尝试使用knitr :: knit2html而不是使用rmarkdown :: render，它将会起作用
理解为什么