如何从R脚本的configuration文件中获取参数

我会去YAML。 与XML不同，专为人类读写而设计。 R包中存在“yaml”，我相信perl和java包也存在。

http://ftp.heanet.ie/mirrors/cran.r-project.org/web/packages/yaml/index.html

你不能得到比这更多的跨平台：

http://yaml.org/

至少在我写一个YAML FORTRAN包的时候

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例。 假设你有config.yml：

 db: host : foo.example.com name : Foo Base user : user453 pass : zoom 

然后yaml.load_file（“config.yml”）返回：

 $db $db$pass [1] "zoom" $db$user [1] "user453" $db$name [1] "Foo Base" $db$host [1] "foo.example.com" 

所以你也是：

 library(yaml) config = yaml.load_file("config.yml") dbConnect(PgSQL(), host=config$db$host, dbname=config$db$name, user=config$db$user, password=config$db$pass) 

根据需要添加尽可能多的部分和参数。 Sweeeeyit。

yaml.load_file将您的配置作为R列表返回，您可以使用$ -notation访问列表的已命名元素。

你可以在你的主脚本的顶部输入source()一个R脚本来读取你的配置文件参数。 根据您与谁共享脚本，数据库安全性可能存在问题，登录信息以未加密格式存在。 关于这个，最近有一个关于这个问题的问题，我会看看我能否在一分钟内找到答案。

总之，将所有数据库参数存储在名为config.R的文件中，然后在主脚本上运行：

 source("config.R") #Will create four objects named "db_host, db_name, db_user, db_pass" dbConnect(PgSQL(), host=db_host, dbname=db_name, user=db_user, password=db_pass) 

如果你建议使用等号拆分列，那么内建的R函数read.table可以很好地处理这种INI格式。

 key.val<-read.table(filename, sep="=", col.names=c("key","value"), as.is=c(1,2)) 

如果您想要更传统的INI行为，以便您可以使用多个配置文件，请尝试将键值对分配给R环境。 例如：

 read.config<-function(filename) { conf.vars<-new.env() for (f in filename) { if (file.exists(f)) { header<-1 key.val<-read.table(f, sep="=", col.names=c("key","value"), skip=header, as.is=c(1,2)) for (kidx in seq(length(key.val$key))) { assign(key.val[["key"]][kidx], key.val[["value"]][kidx], envir=conf.vars) } } } return(conf.vars) } get.config<-function(name) { kv.env=read.config(c("project.cfg","project_local.cfg")) return(kv.env[[name]]) } 

你在这里描述的是一个系统，平台，语言， 通用配置的愿望…

这是一个很大的话题，在这方面已经流传了很多墨水。 有些人认为XML是答案，其他人更喜欢简单的相关格式，如JSON。 你也可以尝试Apache风格的配置文件，因为大多数语言都有它的库（但是R可能是个例外）。

我碰巧喜欢Google协议缓冲区 ，它是快速，高效，跨平台，多语言，向前兼容…但有一个缺点是不ascii文件（虽然你可以先读取ascii文件，然后创建原始文件） 。 对于R，有RProtoBuf包。