在R软件包中进行更改并在Ubuntu上进行安装

简单的问题：我想编辑RPostgreSQL包中的postgresqlWriteTable函数，并将其安装在运行在Ubuntu机器上的R上。

长解释：

我的问题的根源是，我正尝试使用RPostgreSQL包中的dbWriteTable从R中的自动递增主键列写入postgres表。

我读了这篇文章： 如何用自动增量主键将数据从R写入PostgreSQL表？ 它通过改变RPostgreSQL包中的函数postgresqlWriteTable来解决我的问题。 当我在OSX环境中交互式地使用fixInNamespace并且编辑函数时，它是有效的。

• heroku db：当我没有指定密码时，由于缺less密码而导致失败
• 一些PostgreSQL数据库通过像Navicat或pgAdmin这样的客户端不可见
• sudo gem install pg将不起作用
• 在Ubuntu上安装psycopg2
• 不能使用uuid并创build一个扩展名来使用它

不幸的是，我必须在Ubuntu上运行R的AWS实例上运行我的脚本。 我在我的机器上的这个位置安装了RPostgreSQL ： /usr/local/lib/R/site-library/RPostgreSQL 。 我通过调用R CMD install RPostgreSQL_0.4-1.tar.gz安装它

现在我试图find函数postgresqlWriteTable 。 它应该在文件PostgreSQLSupport.R 。 我搜查了整个图书馆 – 没有这样的文件。

我意识到在OSX Finder的本地机器上，当我解压缩tar.gz包文件夹时，我可以看到PostgreSQLSupport.R文件，我应该改变这个function。

所以我改变了function。 然后，我从我的Ubuntu机器上移除已安装的RPostgreSQL，并将新文件夹（从本地机器）复制到我的Ubuntu机器上，并尝试使用devtools来安装软件包，如后文所述： 从自定义目录加载R软件包

这是发生了什么事情：

 > library("devtools") > install("/usr/local/lib/R/site-library/RPostgreSQL") Error: Can't find '/usr/local/lib/R/site-library/RPostgreSQL'. > install("RPostgreSQL", "/usr/local/lib/R/site-library/RPostgreSQL") Installing RPostgreSQL '/usr/lib/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore --quiet \ CMD INSTALL '/datasci/nikhil/RPostgreSQL' \ --library='/usr/local/lib/R/site-library' --install-tests * installing *source* package 'RPostgreSQL' ... file 'R/PostgreSQLSupport.R' has the wrong MD5 checksum ERROR: 'configure' exists but is not executable -- see the 'R Installation and Administration Manual' * removing '/usr/local/lib/R/site-library/RPostgreSQL' Error: Command failed (1) 

我不知道该怎么做 ！